IT 新冠待解：我们“看到”了病毒 但不知道来自哪里、如何而来( 三 )
揭示过H5N1和H7N9等禽流感病毒跨种传播的分子机制的中科院微生物研究所研究员施一在接受澎湃新闻（www.thepaper.cn）采访人员采访时表示，新冠病毒究竟从哪里来不是一个容易回答的问题，“实际上病毒溯源不仅仅简单的某方面研究，它需要结合流行病学，而流行病学证据是会湮灭在历史当中，在某个阶段可能会存在一些生物学的样本证据，过了半年或者更久之后，这个证据就不可能再继续存在了 。”
10月底，石正丽在湖北武汉举行的第十五届国际基因组学大会（ICG-15）上发表了一场主旨演讲，她谈到溯源问题时表示，尽管武汉早期的患者大部分有华南海鲜市场接触史，且在该市场的环境样本中检测到病毒RNA，然而其团队在对市场冻肉和周边养殖动物的检测中均未发现病毒RNA 。
石正丽认为，现有的证据只能表明华南海鲜市场内发生了病毒的人际传播，但它可能并不是病毒从动物跨物种传播到人的疫情源头 。石正丽在上述会议期间对澎湃新闻（www.thepaper.cn）采访人员表示，其团队在病毒溯源这块暂时并无进展 。
石正丽被誉为“蝙蝠女侠”，其团队也是中国SARS病毒的源头攻克团队 。2017年，石正丽等人在追寻、研究13年之后，终于在云南昆明地区一个小山洞里的蝙蝠身上发现了SARS病毒所有基因组成，基本完成了对SARS病毒的溯源工作 。
在此次疫情中，中科院上海巴斯德研究所研究员郝沛与军事医学研究院国家应急防控药物工程技术研究中心研究员钟武、中科院分子植物科学卓越创新中心研究员李轩等人组成的团队，和石正丽等人率领的团队，分别在1月21日和1月23日对外公布研究结论，均揭示了新冠病毒与蝙蝠之间存在的相关性 。这是最早关于病毒源头的研究信息 。
然而，面对新冠病毒的溯源问题时，科学家更棘手的是中间宿主一环至今仍缺失 。在SARS时期，果子狸是其中间宿主；在MERS疫情中，单峰骆驼则扮演了这一角色 。尽管目前有研究团队认为，穿山甲可能是中间宿主；此外有团队通过研究发现，雪貂、猫等其他动物也对SARS-CoV-2易感 。但究竟谁是新冠病毒的“果子狸”？一切尚在猜测中 。
《柳叶刀传染病学》（The Lancet Infectious Diseases）在9月发表的一篇文章中专门讨论了SARS-CoV-2的起源 。“追踪蝙蝠只会给你部分信息，你正在研究的病毒可能会也可能不会获得它们在人类中传播所需的进一步突变 。”美国爱荷华大学微生物学和免疫学教授Stanley Perlman解释说，“几乎总是有一个中间宿主参与其中，如果不知道中间宿主是什么，以及这种病毒会发生什么变化，就很难做出任何预测 。”
但英国格拉斯哥大学医学研究委员会病毒研究中心生物信息学主任David Robertson也表示，现在就排除蝙蝠与人类直接传播的可能性还为时过早 。
7月底，Robertson等人在顶级学术期刊《自然-微生物学》（Nature Microbiology）在线发表了一篇论文，他们使用有关sarbecovirus的基因组数据、采用了三种方法来鉴定未经历重组的以及可用于重构病毒演化历史的SARS-CoV-2病毒区域 。所有方法均表明，RaTG13和SARS-CoV-2拥有共同的单一祖先谱系，估计SARS-CoV-2分别在1948年、1969年和1982年从相关的蝙蝠病毒sarbecovirus中分化出来 。
这一发现意味着产生SARS-CoV-2的病毒谱系可能已经在蝙蝠中传播几十年了 。Robertson等人认为，SARS-CoV-2分化时间长表明可能存在未取样、具有潜在传染力的蝙蝠病毒谱系，这种传染力来源于承自祖先的SARS-CoV-2 RBD上人适应接触残基的遗传位点；不过还需要更好地进行采样来评估这一点 。
他们总结表示，蝙蝠病毒谱系中病毒重组的现有多样性和动态过程，证明了要事先鉴定出有可能引发重大人类疫情暴发的病毒有多么困难 。
石正丽等人在10月发表的一篇新冠病毒的综述文章中指出，目前，我们对SARS-CoV-2动物起源的了解还很不完整，病毒的宿主还没有被明确证实 。目前尚不清楚SARS-CoV-2是否通过中间宿主传播给人类，以及哪些动物可能作为中间宿主 。
谣言正在褪去，真相仍在寻找
病毒溯源之路漫漫，但阴谋论很快来袭 。
2020年2月前后，“实验室病毒泄漏”、“人为制造新病毒”等言论在网络上日渐发酵，阴影开始笼罩在一些科学家身上 。美国非营利组织生态健康联盟（EcoHealth Alliance）疾病生态学家Peter Daszak在接受《科学》杂志（Science）采访时表示，每当新疾病、新病毒出现时，都会产生诸如实验室泄漏或者生物工程制造一类的“阴谋论”，“这令人羞耻！”石正丽甚至不得不在朋友圈回应，“2019新型冠状病毒是大自然给人类不文明生活习惯的惩罚，我石正丽用我的生命担保，和实验室没有关系 。”
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