新浪科技|谷歌Deepmind称解决蛋白质折叠难题 或加速药物研发
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据报道 , Alphabet旗下人工智能公司DeepMind开发了一款软件 , 可以准确预测蛋白质在几天时间里会折叠成什么样的结构 , 从而解决了过去50年的一项“重大挑战” 。 这可能为更好地了解疾病和药物研发铺平道路 。
每个活细胞体内都有成千上万种不同的蛋白质 , 这些蛋白质也是细胞生存的基础 。 预测蛋白质如何折叠非常重要 , 因为这决定了蛋白质的性质 。 几乎所有疾病 , 包括癌症和老年痴呆症 , 都与蛋白质的功能有关 。
欧洲生物信息学研究所的珍妮特·桑顿(Dame Janet Thornton)教授表示:“蛋白质是最美丽的结构 。 准确预测蛋白质的折叠非常具有挑战性 , 多年来一直困扰着很多人 。 ”
DeepMind的AlphaFold人工智能系统参加了一项由“结构预测关键评估”组织(CASP)举办的比赛 。 该组织的目标是 , 围绕如何计算蛋白质分子三维结构的问题 , 更快地寻找解决方案 。
CASP在过去25年中一直在关注这个领域的进展 , 该组织的评价方式是将参赛者提供的解决方案与“黄金试验标准”进行对比 。 本周一 , 该组织表示 , DeepMind的AlphaFold系统在蛋白质结构预测方面表现出了无与伦比的准确性 。
CASP主席约翰·墨尔特(John Moult)教授表示:“DeepMind已经取得领先 。 计算机科学领域长达50年的重大挑战在很大程度上已得到解决 。 对于药物设计 , 以及蛋白质设计等新兴领域 , 这都将产生重大影响 。 ”
DeepMind大约有1000名员工 , 但几乎没有任何收入 。 谷歌母公司Alphabet为支持该公司投入了巨额成本 。 不过 , DeepMind已经与Facebook人工智能实验室、微软和OpenAI等实体一起 , 成为了全球人工智能竞赛的领先者之一 。
谷歌CEO桑达尔·皮查伊(Sundar Pichai)在Twitter上为此次突破点赞 。 DeepMind联合创始人及CEO德米斯·哈萨比斯(Demis Hassabis)则表示:“DeepMind背后的终极愿景一直是构建通用人工智能 , 利用通用人工智能来极大地加速科学发现的步伐 , 帮助我们更好地了解周围世界 。 ”
谷歌2014年以6亿美元的价格收购了DeepMind 。 该公司以围棋人工智能AlphaGo而闻名 。 不过该公司一直表示 , 希望能在科学领域发挥更大的影响力 。
哈萨比斯说:“游戏是很好的试验平台 , 有助于高效地开发和测试通用算法 。 但我们希望 , 未来某天这些算法能应用到现实世界 , 例如去解决科学问题 。 我们认为 , AlphaFold是证明这个逻辑的第一步 。 这些算法现在正变得足够成熟和强大 , 能够应用于真正具有挑战性的科学问题 。 ”
DeepMind早在2018年就参加了CASP蛋白质折叠比赛 , 取得的结果相当不错 。 但AlphaFold负责人约翰·姜普(John Jumper)当时认为 , 要想产出“真正具有生物学相关性 , 或在实验上有竞争力”的成果 , 还有一段路要走 。
今年的比赛对DeepMind来说也并非一帆风顺 。 姜普表示 , DeepMind在3个月时间里毫无进展 。 “我们坐在那里 , 担心是否已经耗尽了数据 。 ”即使比赛结束日期临近 , 姜普及其团队也还在担心 , 他们可能出了错 。 他说:“机器学习系统总是会出各种错误 。 ”
【新浪科技|谷歌Deepmind称解决蛋白质折叠难题 或加速药物研发】不过 , 他们的努力已经获得了回报 。 姜普表示:“我们真的认为 , 我们开发了一个系统 , 为实验生物学家提供正确、可操作的信息 。 你想要寻找这样的结构是因为 , 你想要去理解大自然 , 随后去提出更多的问题 。 我们认为 , 我们开发的系统已经可以真正帮助人们去做到这一点 。 ”
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