|诺奖得主给复旦本科生上课( 二 )
上世纪60年代 , 莱维特看了诺奖得主约翰·肯德鲁主讲的电视节目《生命之线:分子生物学导论》后 , 写信给在剑桥大学工作的肯德鲁 , 希望做他的博士生 。 然而肯德鲁回信说 , 博士生名额已满 。 莱维特的一个朋友得知此事后告诉他:“在商业上 , 当别人对你说‘不’时 , 你要给他另一个可以说‘是’的选择 。 ”于是 , 他又写信给肯德鲁:“如果明年不能做您的博士生 , 那以后可以吗?”看到这个年轻人如此执着 , 肯德鲁邀他来剑桥面谈 , 并推荐他到魏茨曼科学研究所研究计算生物学 。 在研究所 , 莱维特遇到了46年后与他分享诺奖的合作者亚利耶·瓦谢尔 。 “这就是serendipity 。 你们要对事业充满热情 , 坚持不懈 , 善于创新 , 还要做善良的人 。 ”
如何加快发展计算生物学
据了解 , 莱维特今年3月来沪后的主要工作 , 是指导复旦团队研究计算生物学 。 目前 , 复旦大学复杂体系多尺度研究院研发的“作品折叠”(OPUS-Fold)软件 , 在蛋白质侧链结构预测精度上超越了“阿尔法折叠2” , 相关论文将发表在英国《生物信息学简报》上 。 马剑鹏介绍 , 以蛋白质为靶点的药物分子大多与侧链发生作用 , 只有获得高精度的侧链结构 , 才可能设计出药物分子 , 所以这一突破对新药研发具有重要意义 。
不过 , 从整个系统来看 , “阿尔法折叠2”仍处于全球领先地位 。 深度思维首席执行官德米斯·哈萨比斯近日宣布 , 公司与欧洲生物信息学研究所合作建立蛋白质结构数据库 , 提供35万种以上蛋白质结构的数据访问权限 。 深度思维计划将数据库扩大至1亿种以上蛋白质的结构 , 覆盖人类已知的几乎所有蛋白质 。
“阿尔法折叠2”让计算生物学驶入了快车道 , 很多科研团队在开发这类软件 。 今年7月 , 华盛顿大学团队在《科学》杂志发表论文 , 介绍了开源软件“罗塞塔折叠”(RoseTTAFold) , 它不仅能预测蛋白质结构 , 还能预测多种蛋白质的结合形式 。 8月 , 斯坦福大学团队发表《科学》封面论文 , 介绍了人工智能算法预测RNA(核糖核酸)三维结构的突破性进展 。
【|诺奖得主给复旦本科生上课】很多科学家认为 , 蛋白质结构的精准预测是一场科技革命 , 将引发生物医药、新材料等产业变革 。 上海交通大学Med-X研究院副院长殷卫海说:“从预测蛋白质结构、寻找药物靶点到药物分子设计 , 再到临床试验设计 , 人工智能正在全面进入医药行业 , 开始发挥关键作用 。 ”科学家还能利用人工智能软件研发新材料 , 如设计出自然界不存在的蛋白质材料 , 用于化工、能源、环保等行业 。
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