-nCoV|知识分享:质粒提取
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实验原理
现在较常用的质粒提取方法有三种:碱裂解法、煮沸法和去污剂裂解法 , 前两种方法较为剧烈 , 适用于较小的质粒(<15Kb) , 而去污剂裂解法则比较温合 , 一般用于分子量较大的质粒(>15Kb) 。
碱裂解法是一种最广泛使用的制备质粒DNA的方法 。 其原理为:染色体DNA远大于质粒DNA , 且染色体DNA为线状分子 , 而质粒为共价闭合环状分子 。 当pH值为 12.0-12.6 , 碱性环境中 , 线性的大分子的染色体DNA完全变性且无法复性 , 而共价闭环质粒DNA在将PH调至中性后即可恢复其天然构象;在高盐浓度存在的条件下 , 染色体DNA和蛋白质在去污剂SDS的作用下形成沉淀 , 而质粒DNA为可溶状态 , 通过离心可除去大部分细胞碎片、染色体DNA、RNA及蛋白质 , 质粒DNA仍在上清中 。 残留的杂质可以通过酚氯仿处理掉 。
实验过程
1、实验试剂
(1)溶液Ⅰ 50mMl 葡萄糖 / 10mMl EDTA / 25mMl Tris-HCl,pH=8.0;
(2)溶液Ⅱ 0.2Ml NaOH / 1% SDS;
(3)溶液Ⅲ 3Ml 醋酸钾 / 2Ml 醋酸;
(4)异丙醇 , 无水乙醇 , 75%乙醇应放-20℃冰箱预冷备用;
酚氯仿放4℃冰箱预存;
(5)摇菌 , 2-3ml相应抗性的LB培养液 , 在37℃温度下过夜培养 。
2、质粒提取
(1)菌液12000rcf离心5min , 弃掉上清 , 加入0.2ml溶液I(已加入RNase) , 充分混匀后 , 加入0.25ml溶液II , 颠倒混匀 , 室温放置5min , 加入0.4ml 溶液III , 颠倒混匀后 , 13000rcf 离心30min 。
(2)上清转入新的1.5mlEP管中 , 加入等体积的酚氯仿混合液 , 充分混匀 。 10000rcf 离心10min 。
【-nCoV|知识分享:质粒提取】(3)取上清 , 转入新的EP管 , 加入等体积、预冷的异丙醇 , 充分混匀后 , 13000rcf 离心 6min 。
(4)倒掉上清液 , 用1ml预冷的75%乙醇 , 颠倒后 , 13000rcf 离心 1min 。
(5)倒掉上清液 , 沿壁加入1ml预冷的75%乙醇 , 直接倒掉 。
(6)沿壁加入1ml预冷的乙醇 , 直接倒掉 。 倒扣5min后 , 室温下放置10min 。
待管内液体会发干净后 , 向管内加入100ul水 , 55℃孵育5min 。
(7)所得质粒溶液可以放入-20℃中长期保存 。
注意事项
1、若菌株为革兰氏阳性菌 , 该菌有一层细胞壁 , 必须加入溶菌酶才能使之溶解 。
2、摇床速度不宜过高 。 达到OD600 1.5即可 。
3、溶液I加入RNase后需要放在4℃中保存 , 以防酶失活 。
4、溶液II和溶液III使用前需注意观察是否有沉淀 , 如有沉淀可37℃水浴处理 。
5、溶液II处理菌体时间应控制在5分钟以内 。
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