coprimer技术检测癌症突变肿瘤光谱分析 _光谱分析

“泛癌症图谱”(Pan-Cancer Atlas)大型研究项目，源于2012年在加利福尼亚州的圣克鲁兹召开的一次国际癌症医学会议，此次会议发起了一项被称为泛癌症图谱研究计划的大型合作，研究者们希望从一个新的角度来研究癌症。
提出革命性问题，并进行相关的研究，并取得了重大突破。
【coprimer技术检测癌症突变肿瘤光谱分析】“泛癌症图谱”(Pan-Cancer Atlas)的研究分了三个主题（癌细胞起源、致癌过程和信号通路），涉及33种肿瘤，11,000多个肿瘤样本。是一次大型的科学研究项目。该项目提出了许多具有重要价值的问题，并通过研究得到了相应的结论，对未来的癌症理解和治疗将产生革命性的影响。

癌细胞起源

比如在癌细胞起源这个主题的述评论文中Hoadley提出了这样一个问题：“癌症可以根据分子标记而不是细胞/组织来源进行分类和治疗吗？”，这是一个能够颠覆当今癌症治疗的革命性问题。

是什么意思？意思是以后，医学界制定癌症治疗策略时不会再依据肺癌、肝癌、胃癌等制定治疗指南，而将代之以癌症特定的分子特征来制定治疗策略，即呆在不同部位的肿瘤可以使用同样的疗法，而呆在同一部位的肿瘤则可能使用不同的治疗方法。比如都是乳腺癌患者，但三阴乳腺癌就需要不同的治疗方式。（三阴乳腺癌特指雌激素受体（ER）、孕激素受体（PR）及人表皮生长因子受体2（HER-2）均阴性的乳腺癌患者。）

文章插图
图示：人体有29个部位是癌症的高发部位。但以后医学指南不会再简单的根据部位来给出不同的治疗指南和建议了。
容易患癌的解剖学部位分组：
大脑; 眼睛; 头部和颈部; 食道;
甲状腺; 乳腺；胸腺；胰腺；肾上腺；前列腺
肺; 胃；肝；胆管; 肾；膀胱; 结直肠；睾丸
皮肤；血液; 骨骼; 骨髓; 淋巴结；神经系统；胸膜;
子宫颈; 子宫；卵巢
他们的研究小组，在这33种肿瘤中找到了28种不同的分子亚型，他们研究了非整倍体，DNA甲基化，mRNA和miRNA，并研究了细胞或组织来源与肿瘤的分子特征之间的关系。而最重要的发现是，癌症起源的细胞能影响但并不能完全决定肿瘤的分类，并且癌症亚型的完整分子特征，可能导致在治疗时，将患者分到不同的组中去的巨大变化，这个发现必将颠覆现在的癌症的治疗。
Hoadley明确提出：尽管从同一解剖部位产生的恶性肿瘤传统上一直作为单一实体在临床上进行治疗，但组织学和分子分类现在经常用于确定对肺，乳房，胃肠，皮肤和骨髓衍生的恶性肿瘤的亚型的治疗。随着临床上越来越多的药物可用于靶向ALK，EGFR，ERBB2，ERα，KIT，BRAF和ABL1等癌症驱动途径靶点，传统的解剖癌症分类系统应该由基于分子改变的分类系统进行补充跨越不同组织类型的肿瘤。

信号途径

Sanchez-Vega 等对信号途径研究的最关键发现是，超过一半的肿瘤样本在细胞信号通路中至少有一个突变，并且许多肿瘤在多个信号通路中都有突变，这表明肿瘤的分子特征可能导致，可用的组合式疗法。

致癌过程

按照，致癌过程的述评文章作者的说法，这既是“癌症基因组学研究的结束”也是一次新的开始。对于大多数癌症，带来了在分子水平上分析单个肿瘤细胞的更简单实用的方法。
这一成果将是癌症生物学研究中的丰碑，具有不亚于人类基因组测序的意义。
从2012年到2018年，历时六年，史上最大规模癌症基因组研究告一段落，Cell Press杂志上特别发表了一系列共计27篇论文，这些论文是迄今为止最全面的人类癌症基因组分析论文。这个大型研究项目是由美国国家癌症研究所（NCI）和美国国家人类基因组研究所（NHGRI）之间的一次合作，共分析了33种不同的癌症共计11,000多个肿瘤样本。
所有研究资源都是开放获取的，全球有志于研究癌症的个人、组织、公司和药厂都可以使用这些数据，除已经取得的成果之外，人们还可以在源数据的基础上做自己的特别的个性化研究，而这些开放的资源，必将能促进治疗癌症的新方法诞生。
“泛癌症图谱”(Pan-Cancer Atlas)的所有研究结果都在cell.com网站上，网站为此做了特别的专题，将它分为三个主题：（癌）细胞起源，致癌过程和信号通路。每个大类都有一篇述评文章，介绍这个主题并总结该主题下所取得的研究成果。对于任何癌症研究者，至少这些文章是必须精读细读的。