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主要区别在于外形不同、栖息环境不同、生活习性不同 。
1、外形不同
【豚鼠和仓鼠的区别】仓鼠是小到大身体紧凑的鼠形啮齿动物 。体型短粗,体重30~1000克。尾部长度范围从70~106毫米,一般是体长的一半,无鳞,上覆密毛,少数种类（如沙漠小仓鼠 ）则很短,不及后足的一半；某些物种的雌性比雄性大 。尾毛色差异较大,一般为灰色、灰褐或沙褐色,原仓鼠毛色比较鲜艳,背部红褐色,腹部黑 。
豚鼠的体形在啮齿类动物中偏大,体重在700~1200克（1.5~2.5磅）之间,体长在20~25厘米（8~10英寸）之间 。身材短小但是强壮有力,头较大,是身体的三分之一,眼睛大而圆,耳朵短小贴着头部,毛发粗糙而且很容易脱落,没有尾巴 。
2、栖息环境不同
仓鼠广泛栖息于草原、农田、荒漠、山麓及河谷的灌丛,农田,花园和果园中,偶尔也进入房舍 。可以在高达3600米的海拔找到仓鼠 。
豚鼠栖息于岩石坡、草地、林缘和沼泽 。集成5~10只的小群,穴居,夜间活动 。他们可以生活在广阔的海拔范围内,从海平面到4000米 。虽然研究表明它们不能在极端炎热或寒冷的环境中生存,但豚鼠可以承受从白天22?C到夜间-7?C的大范围温度 。
3、生活习性不同
仓鼠主要以植物种子为食,兼吃植物嫩茎和叶,果实,偶尔也吃昆虫 。不冬眠 。冬季靠吃贮存的食物生活 。
豚鼠以植物性食物为食,在食物上没有特殊要求,体质强健不易生病 。
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