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华深智|AlphaFold2迎来劲敌，中国团队携HeliXonAI打破全球蛋白质结构预测记录( 二 )

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据悉 ， HeliXonAI 通过数据蒸馏技术引进大型无结构氨基酸序列的资源数据库 ， 而且对模型作了全新的进化设计调整（Evolutionary Calibration） ， 实现了多序列比对的信息校正 。
此外 ， 在空间坐标优化方面 ， HeliXonAI 添加了几何平滑（Geometric Smoothing）模块 ， 凭借几何深度学习（Geometric Deep Learning）算法以及 1000 层左右的深度 ， 对坐标进行不断地优化 。
在上述提到的调整下 ， HeliXonAI 不仅能够有效地解决同源信号不强的问题 ， 而且可在原子级别上做出更准确的预测 。
历时 3 个月的努力 ， HeliXonAI 最终打破了 AlphaFold2 模型以往的预测记录 。
事实上 ， HeliXonAI 的成就与华深智药的多年积累也是分不开的 。
据了解 ， 华深智药的创始人是伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校（University of Illinois at Urbana-Champaign ， 简称 UIUC）计算机科学系及医学院的终身教授彭健 。
他不仅是生物计算领域极具影响力的专家 ， 还是蛋白质结构和功能预测方面的知名科学家 。
2016 年 ， 彭健获得素来有“诺奖风向标”之名的斯隆研究奖（Sloan Research Fellowships） 。 2020 年 ， 他成为奥弗顿奖（Overton Prize） 20 年来的唯一华人得主 ， 该奖项是生物计算领域的最高奖 。
博士在读时 ， 彭健研究出 RaptorX 算法 。 在去往 UIUC 执教时 ， 他又设计出 DeepContact 算法 。 值得一提的是 ， 这些算法曾多次在 CASP 比赛中拿到过亮眼的成绩 。
彭健表示 ， “在新药开发领域 ， 特别是大分子药物开发 ， 华深智药希望用创新性地使用 AI 重构药物开发流程 ， 从而极大程度上提高新药研发速度和效率 。 而 HeliXonAI 平台 ， 就是华深智药第一阶段的成果 。 ”
如今 ， HeliXonAI 平台已开始逐渐在产业化应用方面展现其能力 。
不久前 ， 华深智药联合 AIR 及清华大学医学院 ， 通过其 AI 抗体平台 Helixon Design ， 在新冠病毒抗体的系统设计和优化方面乘风破浪 ， 设计出有广谱抗病毒作用的新冠特效中和抗体 ， 为新一代新冠特效药物带来全新的的研发路径和范式 。
AIR 院长张亚勤表示：“AI 制药是全球 AI 科研和产业关注的热点 ， 新冠病毒的流行给全世界带来新的挑战 ， 华深智药和清华大学团队通力合作 ， 在短时间内开发出 Helixon Design ， 并设计出世界领先的广谱新冠中和抗体 ， 是继 AlphaFold2 之后 AI 在生命科学领域取得的又一里程碑式的突破 。 ”
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