《实用免疫细胞与核酸》 电泳分析
在实际工作中常采用琼脂糖凝胶电泳 。一般情况下先在电泳缓冲液或凝胶中加1%溴化乙锭(EB)(每100ml加100μl) , 然后将已经制备好的1%~2%琼脂糖凝胶(用电泳缓冲液配制)放入电泳槽内 , 加入待测样品10μl , 同时用分子量标准品作标记 。琼脂糖浓度应按分离DNA片段的大小进行选择 , 一般用1.5%~2% , 电泳电压75V , 待样品进行凝胶内距胶末端1cm时 , 切断电源 , 取出凝胶在紫外灯下直接观察结果 。
由于溴化乙锭可与双链DNA形成结合物 , 在紫外灯下能发射荧光 , 使EB的荧光强度增强80~100倍 , 所以 , 电泳后凝胶在紫外灯下可直接观察 。一般肉眼观察DNA量可达10ng , 其荧光强度与DNA含量成正比 。
DNA分子在凝胶中泳动速度决定于电荷效应及分子效应 。前者由所带净电荷量决定 , 而后者与分子大小及构型有关 。按照DNA分子大小 , 其凝胶浓度可做不同的调整 。有条件的实验室也可用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)分析扩增的DNA片段 。
表22-2 电泳检测扩增结果 , EB荧光显色(254nm)
琼脂糖(%)kbPAGR(%)bp0.360~53.5100~10000.620~1 0.710~0.85.080~5000.97~0.58.060~4001.26~0.412.040~2001.54~0.220.0
第四节 影响PCR的主要因素
PCR技术必须有人工合成的合理引物和提取的样品DNA , 然后才进行自动热循环 , 最后进行产物鉴定与分析 。引物设计与合成目前只能在少数技术力量较强的研究院、所进行 , 临床应用只需购买PCR检测试剂盒就可开展工作 , PCR自动热循环中影响因素很多 , 对不同的DNA样品 , PCR反应中各种成份加入量和温度循环参数均不一致 。现将几种主要影响因素介绍如下 。
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