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【我们误读病毒了？为什么科学家说，病毒是大自然基因创新的动力？】
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在人类的发展历程中 ， 病毒的名声一直不好 ， 它们一直被当作掠夺生命的恶魔 。
人类历史上的几场瘟疫浩劫 ， 超过一半都与病毒关 ， 最骇人听闻的是“西班牙流感”病毒 。 在第一次世界大战结束那一年（1918年） ， 因为全球贸易的发展 ， 这种病毒在一年内感染了全球三分之一的人口（5亿人） ， 让5000万到1亿人失去生命 。 而第一次世界大战造成的死亡人数才4000万 。
最让我们印象深刻的还是最近的“新冠”病毒 ， 即使现代医学如此发达 ， 一年多时间过去 ， 我们仍然深陷在对病毒的恐惧当中 。 然而 ， 很多科学家却在为病毒“说好话” ， 为病毒“正名” ， 这又是为什么？
一位叫伊万·埃里尔（Ivan Eril）的生物学家相信 ， 至少有一种特定类型的病毒对人类是有益的 ， 比如噬菌体或感染细菌的病毒 。 当这些病毒的DNA被细胞捕获时 ， 它可能包含使该细胞能够执行新把戏的指令 。 他更相信 ， 病毒是大自然基因创新的动力 。
细菌病毒的强大威力
噬菌体 ， 可以入侵并控制陆地和海上的细菌 。 据统计 ， 它们每天杀死多达40%的海洋细菌 ， 帮助控制细菌的繁殖和有机物的重新分布 。 而它们选择性杀灭细菌的能力也让医生们兴奋不已 ， 目前 ， 天然和工程化噬菌体已成功用于治疗耐抗生素的细菌感染 。 这一过程被称为噬菌体疗法 ， 可以帮助对抗抗生素耐药性 。
最近的研究指出了噬菌体的另一个重要功能：它们可能是自然界最终的基因修补者 ， 能够制造出新的基因 ， 使细胞能够重组以获得新的功能 。
噬菌体是这个星球上最丰富的生命形式 ， 大约有1诺亿个噬菌体（诺亿是数目名称 ， 1000的10次方） ， 随时在世界各地游动 。 与所有病毒一样 ， 噬菌体也有很高的复制率和突变率 ， 这意味着它们在每次繁殖时都会形成许多具有不同特征的变体 。
大多数噬菌体都有一个称为衣壳的坚硬外壳 ， 里面充满了它们的遗传物质 。 在许多情况下 ， 外壳的空间超过了噬菌体储存复制所需DNA的空间 。 这意味着噬菌体有足够的空间携带额外的基因包袱：对生存不重要的基因可以随意修改 。
细菌的基因开关
为了了解这是如何发挥作用 ， 科学家深入研究噬菌体生命周期 。 对我们来说 ， 噬菌体有两种主要的类型：温和的和有毒的 。 像许多其他病毒一样 ， 有毒的噬菌体会经历入侵-复制-杀死宿主的生命历程 。 它们入侵宿主 ， 劫持宿主细胞内的组件 ， 复制自己 ， 然后爆发 。
另一方面 ， 温和的噬菌体起着长期的作用 。 它们将自己的DNA与细胞的DNA融合 ， 并可能休眠多年 ， 直到有什么东西触发它们的激活 。 然后 ， 它们又恢复了毒性行为：复制并爆发 。
许多温和的噬菌体使用DNA损伤作为触发因素 。 如果细胞的DNA被破坏 ， 这意味着驻留的噬菌体会跳船 。 但如果没有检测到宿主细胞的DNA损伤 ， 指导噬菌体复制和爆发的基因会一直被关闭 。
细菌重组了控制生命周期的机制 ， 产生了一个复杂的遗传系统 ， 也会促进细菌的进化 。 如果它们检测到DNA被破坏 ， 它们会激活一组试图修复DNA的基因 。 这被称为细菌SOS反应 ， 因为如果失败 ， 细胞就会死亡 。 细菌利用一种对DNA损伤做出反应的开关状蛋白质来协调SOS反应：如果有损伤 ， 它会打开 ， 如果没有 ， 它会关闭 。
也许并不奇怪 ， 细菌和噬菌体开关在进化上是相关的 。 这就引出了一个问题：是谁发明了这个“开关” ， 是细菌还是病毒？
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