泛癌免疫分析也可以做的这样简单!( 二 )
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Fig.6
在分析中观察到TIME因子和ICPs表现出共现性而不是互斥性 。 此外 , OS (Fig.7A)、无进展生存期(PFS) (Fig.7B)、DFS (Fig.7C)和疾病特异性生存期(DSS) (Fig.7D)的综合预后分析表明 , TIME因子和ICPs的综合基因组改变对胰腺癌患者的多个预后显著不利 。
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Fig.7
04
ICPs、TIME因子、ICD介质和肿瘤免疫之间的关系
使用GEPIA进一步研究了胰腺癌中ICD介质、TIME因子、ICPs和effective T-cell signature之间的相关性 。 首先 , 确定了TIME因子与ICPs之间的显著相关性(R=0.93 , P<0.01) (Fig.8A) , ICD介质和ICPs(R=0.92 , P<0.01) (Fig.8B) , 以及ICD介质和TIME因子(R=0.94 , P<0.01) (Fig.8C) 。 此外 , ICPs与 effective T-cell signature(CX3CR1、FGFBP2和FCGR3A)之间也存在显著的相关性(R=0.87、P<0.01)(Fig.8D) , TIME因子和 effective T-cell signature(R=0.80 , P<0.01) (Fig.8E) , 以及ICD介质和 effective T-cell signature(R=0.88 , P<0.01) (Fig.8F) 。
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Fig.8
为了进一步证实ICD与TILs的相关性及其潜在的影响 , 选择了8个具有代表性的ICD介质 , 并使用肿瘤和免疫系统相互作用数据库(TISIDB)对多种癌症类型进行了相关性分析 。 热图显示 , 在大多数恶性肿瘤中 , TILs与多个具有代表性的ICD介质显著相关 , 如CALR、LRP1 , ANXA1 , FPR1 , TLR3、IFNAR1 , PANX1 , 和P2RX7(Fig.9A-H) 。
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Fig.9
小编总结
本研究结合了TCGA和其他几个开放的基因组数据库来分析ICB治疗的缺陷 。 强调了抗癌免疫治疗中靶向TIME因子的潜在作用 , 并进一步讨论了联合靶向ICPs和TIME因子的组合策略 , 有利于肿瘤内T细胞浸润 , 增强ICB疗效,提出了将TIME因子的靶向作用纳入抗癌药物的意义 。
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