另外值得一提的是 ， 北京时间7月15日 ， DeepMind团队在顶级学术期刊《自然》（Nature）在线发表了一篇题为“Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold”的论文 ， 全面详述了2020年底造成轰动的模型 ， 并首次对外分享开源代码 。
“有人在说AlphaFold开源了 ， 我们国家不用搞了 ， 这是大错特错 。 ”马剑鹏解释 ， “第一 ， 他们所谓的开源只是表层结构开源了 ， 底层技术没有开源 。 第二 ， 你把它拿来你只能做他们的东西 ， 你没有办法提高 ， 就像航空发动机你买来可以 ， 你能往前在进一步吗？不可能 。 ”
他甚至认为 ， 对于国家来说 ， 这是核心卡脖子技术之一 。 “我们必须从核心算法等底层技术做起 ， 这也是我们现在重中之重的工作 。 ”据介绍 ， 复旦大学复杂体系多尺度研究院在蛋白质结构预测领域近期也取得突破 ， 其自主研发的opus-fold软件在蛋白质侧链结构的预测精度上 ， 超越了DeepMind的AlphaFold2 ， 相关论文目前处于审稿阶段 。
“研究院刚成立的时候还不是全部集中在计算生物学 ， 但现在比重调过来了 。 我觉得现在计算生物学的势头很强 ， 而且这也是我们的强项 。 在全国的高校中有很多人做冷冻电镜研究 ， 我们不是唯一的一家 ， 但是算法是我们最大的强项 。 ”马剑鹏表示 。
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