洛斯宁|澳大利亚肺鱼拥有已测序最大动物基因组

据英国《新科学家》杂志网站18日报道 , 奥地利分子病理学研究所的科学家发现 , 澳大利亚肺鱼拥有迄今已测序所有动物最大的基因组 , 其基因组共包含430亿对碱基 , 超过人类基因组14倍 。
最新研究负责人齐格弗里德·斯克洛斯宁表示 , 此前最大已测序动物基因组来自墨西哥两栖动物美西螈 。 2018年他们对其进行了测序 , 但澳大利亚肺鱼的基因组比其还大30% 。
在最新研究中 , 科学家们使用高性能计算机测序仪将肺鱼的基因组拼接起来 。 为解决测序仪可能造成的错误 , 研究人员使用了基因组的多个拷贝 , 每个拷贝都被分割成DNA小块 。 在对所有片段进行测序后 , 研究小组使用算法将片段重组成一个完整的基因组 。 斯克洛斯宁估计 , 得到结果需要计算机处理大约10万小时 。
斯克洛斯宁说 , 澳大利亚肺鱼原产于昆士兰州东南部 , 该动物从水基生活方式过渡到陆基生活方式以来 , 其外貌几乎没有什么变化 。
此前 , 科学家们并不清楚肺鱼和腔棘鱼(一种发现于印度洋和印度尼西亚周围的古老鱼类)谁与哺乳动物和鸟类等陆地脊椎动物的关系更密切 。 新基因组分析明确指出 , 肺鱼与四足动物的祖先关系更密切 。 腔棘鱼较早从这些动物中分化出来;而肺鱼在4.2亿年前才与这些动物分道扬镳 。
斯克洛斯宁说:“为离开水 , 肺鱼需要适应陆地的生活方式 , 必须能呼吸空气 , 必须能闻到气味 。 肺鱼背部拥有一个肺 , 供其呼吸水面上的空气 。 ”
在与肺和关节肢体的发育以及嗅探气味有关基因的数量方面 , 澳大利亚肺鱼与两栖动物相似 。 斯克洛斯宁说:“从基因组角度而言 , 澳大利亚肺鱼的基因组介于鱼类和陆地脊椎动物之间 。 ”
【洛斯宁|澳大利亚肺鱼拥有已测序最大动物基因组】来源:科技日报

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