微生物16S扩增子测序分析( 二 ) _微生物

图3 信息分析流程图
注：若合同中未签某种分析或样品不适合做某种分析，则结题报告及结果文件中不会提供相应的结果。
4 科沿有道使用建议
微生物多样性生物信息分析部分是在Linux平台上完成的，数据结果或被压缩成zip、tar.gz、tar等格式，以下介绍了常见的操作方法：
1)文件解压：linux系统解压：zip包解压命令“unzip file.zip” ， tar包解压命令“tar -xvf file.tar” ， tar.gz包解压命令“tar -xzvf file.tar.gz”；windows系统可以使用WINRAR或7-zip解压。
2)查看文本文件：linux或unix用户可以用more、less等命令查看， Windows 用户，可用文本编辑器或写字板打开并编辑文本文件，比如gedit或editplus 。
3)图片查看与编辑：数据中可能包含部分图像文件，一般图像文件后缀名为.png、.pdf、tiff、svg等，对于图像文件， Windows用户可以使用图片浏览器打开， Linux/Unix用户使用display命令打开；如果需要重新修改图片，则建议使用AI编辑器。具体操作：首先，在windows上安装Adobe Illustrator（Adobe Illustrator CS6）软件，双击打开软件；第二步，使用快捷键“Ctrl+o”或者选择“文件-打开”找到pdf文件打开PDF如果是单页的PDF ，可以直接确定。多页PDF ，选择需要修改的页面，在确定后，直接打开要修改的PDF页面，选择左侧工具栏进行编辑；第三步，保存。要存储回原始的多页PDF直接使用“存储”命令即可，快捷键是Ctrl+S如果想将当前编辑的页面存储为单页的PDF ，可以直接选择“存储为”命令，快捷键是“Shift+Ctrl+S” 。
4)表格打开方式：Linux下的表格均为制表符(Tab)分割的文本，可直接用less命令查看（less -SN *.xls）也可使用excel或openoffice等办公软件打开。
(注意：当文件比较大时，打开文件可能导致Windows系统死机，建议使用性能较好的计算机或者使用更适合处理大量数据的Unix/Linux系统打开。 )

微生物16S扩增子测序分析( 二 )

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