IT 研究人员发现与COVID-19重症风险显著增加相关的基因
根据在2021年ATS国际会议上发表的研究 , ABO基因的遗传风险变异可能会大大增加患COVID-19的机会 , 其他基因也可能会增加COVID-19的风险 。关于COVID-19的许多内容仍然是一个医学之谜 , 包括某些基因是否使个人有更大的风险感染SARS-CoV-2病毒 , 该病毒会导致COVID-19 。
不列颠哥伦比亚大学心肺创新中心的博士后Ana Hernandez Cordero及其同事利用综合基因组学与蛋白质组学相结合来确定这些基因 。
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基因组研究确定了可能在生物过程中发挥作用的特定基因 , 如疾病的发展 , 而蛋白质组学也对蛋白质进行研究 。研究人员可以通过整合工具来调查这两方面的情况 , 从而更全面地了解疾病过程 。
Hernandez博士说:"DNA是一个大的、复杂的分子 , 因此 , 仅靠遗传关联不能确定负责COVID-19的确切基因 。然而 , 通过将COVID-19的遗传信息与基因表达和蛋白质组数据集相结合 , 我们可以弄清楚哪些基因在推动与COVID-19的关系 。"
研究人员将遗传信息与肺部基因表达的检查结合起来 , 以确定控制肺部基因表达的遗传变异 , 这些变异是COVID-19的原因 。研究人员确定了特定基因的标记 , 它们对基因表达和蛋白质水平的影响与COVID-19的易感性相同 。为了进行分析 , 他们使用生物信息学来整合 。
1)从感染SARS-CoV-2的病人以及非感染者(对照组)获得的基因组数据集;
2)来自临床人群(非COVID-19)的肺部和血液组织基因表达数据集;
3)从献血者(非COVID-19)获得的蛋白质组数据集 。
他们发现 , 负责免疫系统对COVID-19反应的几个基因也参与了COVID-19的易感性 , 这得到了以前研究结果的支持 。
在血液蛋白中寻找候选基因 , 他们能够更进一步将基因的影响与COVID-19的易感性联系起来 。血液蛋白质组学还可以帮助确定血液中的标记物 , 这些标记物可以很容易地被测量 , 以表明疾病状态 , 并有可能监测疾病 。
"通过利用基因组信息的力量 , 我们确定了与COVID-19有关的基因 , 特别是 , 我们发现ABO基因是COVID-19的一个重要风险因素 。特别值得注意的是血型ABO和COVID-19风险之间的关系 。我们表明 , 这种关系不仅仅是一种关联 , 而是因果关系 。"
除了ABO基因 , 埃尔南德斯博士及其同事发现 , 携带SLC6A20、ERMP1、FCER1G和CA11某些基因变异的人感染COVID-19的风险明显更高 。"这些人在大流行期间应该特别小心 。这些基因也可能被证明是疾病的良好标记以及潜在的药物目标 。"
在研究人员的分析中发现的几个基因已经与呼吸道疾病有关 。例如 , ERMP1已经与哮喘有关 , CA11也可能使糖尿病患者的COVID-19风险升高 。
使用综合基因组学(IG)将COVID-19的遗传关联与基因和蛋白表达结合起来 。IG的目的是确定将遗传密码的影响与复杂疾病联系起来的机制(例如:基因表达水平) 。这些方法虽然复杂 , 但也很快速 , 其结果可以帮助研究人员确定体外(实验室内)和体内(活体)测试的候选基因的优先次序 。
【IT|研究人员发现与COVID-19重症风险显著增加相关的基因】埃尔南德斯博士补充说:"自从我们第一次进行这项分析以来 , 我们的研究已经取得了进展 。我们现在已经为COVID-19确定了更多有趣的候选基因 , 如IL10RB、IFNAR2和OAS1 。这些基因已经与重症COVID-19有关 。它们在对病毒感染的免疫反应中的作用和越来越多的证据表明 , 应该进一步研究这些候选基因和它们在COVID-19中的作用" 。
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